Les frais les plus répandus sont les frais de souscription et les frais de gestion.

Les frais de souscription, inclus dans le prix de la part, sont généralement compris entre 8 et 12%, selon les SCPI. Ils correspondent à la rémunération du service rendu pour la recherche des biens en vue de consolider le patrimoine (frais de notaire et de rémunération des intermédiaires notamment).

Les frais de gestion permettent d'assurer la gestion annuelle du parc immobilier et le fonctionnement quotidien de la SCPI. Ces frais sont généralement compris entre 10 et 15%, en fonction des SCPI. Les rendements sont toujours annoncés et distribués nets de frais de gestion.

Il peut exister d’autres types de frais en fonction des SCPI.